يتيح تطبيق إدارة النظام  System Administrator  التحكم بأمن النظام من خلال مجموعة من الأدوات تحديد اسم المستخدم وكلمة السر لكل مستخدم, تحديد صلاحيات الدخول لمستخدمي النظام, تحديد صلاحيات المشاهدة والتحرير لمستخدمي النظام, إمكانية إدارة المستخدم للوصول إلى البيانات بشكل مؤقت أو دائم , إنشاء تعديل ومسح نسخ لكل جهة / مستخدم حسب الصلاحيات الممنوحة لهم, إمكانية تلبية الحالات التي يكون فيها المستخدم قد نسي كلمة السر الخاصة به, الربط والتكامل مع Active Directory  , تسجيل جميع العمليات والإجراءات التي يقوم بها المستخدم بالنظام ويتضمن نوع العملية أو الإجراء وتاريخ بداية ونهاية تنفيذها.